Durante a maior parte de sua existência, os episódios de Zorro faziam parte de histórias contínuas, cada uma com cerca de treze episódios. Sua estrutura era semelhante à de uma série de televisão. A primeira delas narrava a aparição de Zorro/Diego na Califórnia em 1820, quando ele retornou de seus estudos na Espanha a pedido de seu pai, Don Alejandro, para ajudar a derrubar o ganancioso e cruel comandante local, Capitão Enrique Sanchez Monastario. Após a derrota definitiva de Monastario, na segunda história, Zorro precisa descobrir e confrontar o magistrado Carlos Galindo, que está envolvido em uma conspiração para tomar o poder na Califórnia. A terceira história diz respeito ao líder dessa conspiração, José Sebastián de Varga, uma figura fantasmagórica conhecida como «A Águia». Acontece que Varga pretende obter um enorme lucro entregando a Califórnia a outro país que tem seus próprios interesses na Costa Oeste.
A segunda temporada começa com Diego em Monterey, a capital colonial da Alta Califórnia. As autoridades estão preocupadas com o fato de que o dinheiro arrecadado de forma privada para levar um navio de suprimentos à Califórnia foi repetidamente desviado para uma gangue de bandidos. Diego fica para investigar, tanto como civil quanto como um Zorro mascarado. Ele se interessa por Ana Maria Verdugo, a filha do homem que organizou a operação. Depois que Zorro derrota os ladrões, ele entra em uma rivalidade com seu velho amigo Ricardo del Amo, um brincalhão que também está interessado em Ana Maria. Ana Maria está apaixonada por Zorro. Enquanto estão em Monterey, Zorro e o Sargento Garcia também se envolvem em uma disputa entre os humanos e o repressivo Vice-Governador. No final, Zorro está prestes a desistir de sua máscara para se casar com Ana Maria, mas Don Alejandro o dissuade, revelando que percebeu há algum tempo que seu filho era Zorro e convence Diego de que o povo ainda precisa de Zorro. Zorro se despede de Ana Maria e retorna a Los Angeles, onde eles participam de uma série de aventuras mais curtas.