A equipe de agentes do Departamento Internacional do FBI, a “Fly Team”, já conhecida pelo público e que investiga crimes no exterior, volta às telas. Os agentes de elite, cuja sede fica em Budapeste, terão, mais uma vez, a tarefa de desvendar casos que afetam os interesses americanos ou ameaçam a segurança dos Estados Unidos, tanto no país quanto no exterior. A equipe continua sendo liderada pelo experiente Scott Forrester (Luke Kleintenk) — o agente especial chefe do FBI. Seu braço direito é a agente profissional do FBI e segunda no comando da equipe, Jamie Kellett (Heida Reed). Além deles, a equipe conta com o jovem, mas promissor, agente André Reins (Carter Redwood), que no passado trabalhou como contador, e a novata especializada em conduzir interrogatórios, Cameron Vo (Vinessa Vidotto), que anteriormente atuou como agente de campo em Seattle. A equipe conta com a ajuda da agente veterana da Europol, Catherine Jäger (Christian Paul), que veio da Alemanha, domina vários idiomas e atua como elo de ligação entre os agentes, bem como de sua assistente, a velha conhecida de Forrester, Megan Garretton, também conhecida como Smitty (Eva-Jane Willis), que assumiu o cargo de Katrin no final da temporada anterior. Na segunda temporada, a equipe altamente profissional, composta por cinco superagentes, voltará a viajar pelo mundo com a missão de proteger os americanos, colaborando com os serviços de inteligência locais e as autoridades policiais de diversos países para neutralizar ameaças aos interesses americanos e à segurança internacional. Eles também terão que respeitar as leis estrangeiras e equilibrar situações perigosas para preservar as relações internacionais.
