A protagonista da série é o Fantasma. Trata-se do fantasma de uma garota muito jovem, de dezenove anos, chamada Kato Heaven. Certa vez, Kato recupera a consciência e percebe que está no quarto de algum hotel barato. A garota não consegue se lembrar de como chegou ali e, além disso, tem sensações estranhas, de uma leveza e uma etérea sensação do que está acontecendo. Logo ela começa a perceber que está observando tudo de cima, ou de fora… No banheiro, para seu horror, ela se vê. Ou melhor, vê seu corpo, ensanguentado e mutilado, e compreende que foi assassinada e está morta. Olhando ao redor com atenção, Kato percebe que, ao que tudo indica, ela foi vítima de um assassinato cruel, mas não consegue se lembrar do que exatamente aconteceu com ela. Depois de se acalmar e recuperar a compostura, Kato raciocina com lucidez que, já que existe — mesmo que fora de seu próprio corpo -, não seria nada mal entender os acontecimentos e encontrar o culpado por sua morte. A jovem dá início à sua investigação, ainda mais porque ela tem certas vantagens, devido à sua nova condição. Logo ela descobre que, ao contrário do que pensava, não é invisível. E algumas pessoas conseguem vê-la. No total, no “Hotel Bo Séjour”, há cinco pessoas assim. Entre elas: seu pai — um alcoólatra inveterado; um rapaz com quem ela era amiga; outro jovem, que havia sido recentemente liberado de uma clínica psiquiátrica; sua meia-irmã Kato, de temperamento excêntrico e muito expressivo; e o chefe da polícia local — um corrupto e um sujeito totalmente sem princípios. No decorrer de sua investigação, Kato descobre que teve contato com cada um desses indivíduos no dia de sua trágica morte. Mas ela não consegue entender de forma alguma se algum desses personagens está envolvido em sua morte, como parte de uma conspiração geral, ou se algum deles é diretamente o seu assassino. Paralelamente à própria Kato, duas detetives estão investigando esse assassinato na vida real. O fantasma de Kato acompanha atentamente as ações delas, e isso faz com que ela comece a se aprofundar nos segredos de sua pequena cidade, que, como se descobre, está repleta de mistérios e crimes que se escondem por trás da fachada imponente de uma vida, à primeira vista, vida feliz de uma aconchegante e bem cuidada cidadezinha europeia. Há ali uma enorme quantidade de assassinatos não resolvidos, pessoas desaparecidas que ninguém se dispõe a procurar devidamente, e tráfico de drogas. É claro que para o fantasma muitas coisas são mais claras e compreensíveis, mas nem mesmo ela consegue entender completamente todas as complexas tramas dos acontecimentos que antecederam sua morte num quarto desarrumado de um hotel à beira da estrada. Ela está perdida e não sabe para onde seguir, onde e o que — ou talvez quem — deve procurar…
