Durante o dia, o herói chamado Thomas Anderson é um programador comum, mas ao anoitecer ele se transforma em um hacker Neo. Um dia, o herói recebe uma mensagem, mas não consegue entender sua essência. Para entender tudo, Thomas segue uma desconhecida com uma tatuagem que representa um coelho. A garota leva o herói até Trinity, que conhece o segredo da Matrix. Em seguida, Thomas conhece Morpheus. Ele oferece ao herói a opção de escolher entre duas cápsulas de cores diferentes. Ao escolher a vermelha e tomá-la, Neo se vê em um mundo bizarro, que é significativamente diferente do habitual. Agora Neo é o escolhido e não há como voltar atrás. Morpheus começa a preparar o herói para passar por muitas provações e lhe ensina vários tipos de artes marciais.