O filme fala sobre o distante ano 10190, quando as viagens espaciais se tornam bastante reais e acessíveis a todos os habitantes da Terra. A Guild of Navigators é responsável pela segurança desses voos interplanetários, o que garante a ordem e a paz no espaço intergaláctico. A oportunidade de voar por zonas especiais no espaço e prever o futuro só é possível com o uso de uma poção especial de melange, que pode ser obtida no planeta quase deserto Arrakis, também chamado de Duna. Enquanto isso, no próprio planeta, um conflito político verdadeiramente violento está se desenrolando. Duas dinastias, que vêm lutando há décadas pelo direito de possuir totalmente os recursos do planeta, estão ultrapassando seus limites. Corrino, o Imperador do Universo, determina quem se tornará o governante de Arrakis, mas, em vez da esperada solução do conflito, ele obtém a mais verdadeira guerra sangrenta. Sua escolha recai sobre o clã pacífico de Arteides, que se torna ainda mais odiado pelos Harkonnens. A família gananciosa ataca aqueles que nunca fizeram mal a ninguém e massacra cruelmente todos, exceto o filho do duque, Paul. Agora, o rapaz é forçado a fugir para a população indígena e buscar refúgio e apoio dela, para depois levá-la à guerra contra o cruel imperador e seu círculo íntimo.
