Esse filme se passa em São Francisco. Um jovem cientista chamado Will Rodman realiza experimentos genéticos para encontrar uma cura para o mal de Alzheimer, que seu pai tem. O chimpanzé Caesar é um bebê macaco que Will Rodman vem experimentando. Como resultado dos experimentos, a mãe de Caesar morreu e a pesquisa teve de ser interrompida. Will leva o bebê primata órfão para sua casa e, junto com seu pai, o cria. Os experimentos que mataram a mãe de Caesar levam a resultados surpreendentes: a droga em estudo aumenta várias vezes a inteligência dos macacos. Caesar está ficando cada vez mais inteligente. Ele aprendeu a desenhar, a se comunicar por gestos e a jogar xadrez. Um dia, o chimpanzé, defendendo seu mestre doente, demonstrou agressividade e foi para o berçário com seus irmãos. Lá, graças à sua inteligência, Caesar se torna o líder dos macacos e levanta uma rebelião contra os humanos.
