Kaiju são monstros gigantes que aterrorizam as ilhas japonesas. As pessoas morrem em massa e as cidades entram em colapso. Para combater a ameaça, o governo criou uma força de defesa de elite. Graças aos equipamentos de alta tecnologia, foi possível aumentar a eficácia do confronto com o kaiju e minimizar as perdas nas fileiras das forças especiais. Kafka Hibino passou repetidamente e sem sucesso nos testes para entrar na unidade de elite. Ele conseguiu um emprego em um serviço de limpeza que remove os corpos de kaiju mortos das ruas. Quando Hibino completou 32 anos, teve que dizer adeus às suas esperanças de entrar para um esquadrão de combate.
Os kaiju não têm intenção de parar, apenas aumentar seu ataque. À medida que o número de lutas aumenta, também aumenta o número de defensores mortos. As tropas de elite precisam de lutadores e aumentam o limite de idade dos recrutas em um ano. Agora Hibino pode fazer o teste de admissão mais uma vez. Mas o que ele fará com o parasita kaiju que se instalou em seu corpo?