Ao violar a principal proibição da alquimia e tentar ressuscitar a mãe, os talentosos irmãos Elric pagaram um preço alto: o mais novo, Alphonse, perdeu o corpo e agora sua alma está ligada a uma armadura de aço, enquanto o mais velho, Edward, perdeu o braço e a perna, tendo que usar uma armadura protética. Graças às suas habilidades demonstradas, Ed recebeu o título de Alquimista do Estado e, assim, tornou-se parte da máquina militar do Estado. Agora ele tem a chance de devolver a Al seu antigo corpo. À frente de andanças e aventuras, resolvendo mistérios terríveis e batalhas intermináveis...
Em comparação com a primeira adaptação cinematográfica, na versão atualizada de «The Steel Alchemist», até mesmo o design dos personagens ficou mais «adulto». Em geral, esse é um trabalho mais dinâmico. Desde o primeiro episódio, os personagens são jogados no meio de tudo: o massacre em Istvar, a luta dos renegados com o Exército e o Führer Bradley, os homúnculos e várias «dicas» sobre o desenvolvimento futuro da história.
O conjunto de seiyuu foi quase completamente preservado, e os personagens dos heróis permanecem os mesmos, mas há uma composição diferente de episódios, que desempenham um papel fundamental na formação de imagens e explicam a essência do que está acontecendo. Mais uma vez, a atmosfera séria é diluída por inserções humorísticas, mas os momentos brilhantes de vida feliz foram reduzidos, de modo que a série parece mais sombria. É dada mais atenção aos personagens secundários e de terceira categoria, especialmente os militares. Quanto ao enredo, os temas principais permanecem inalterados: a busca pela Pedra Filosofal, a vingança pelo que foi feito, a política e os planos insidiosos de inimigos misteriosos.